Les missions de l'établissement sont articulées sur des textes réglementaires ou contractuels :
Le contrat quadriennal 2005-2008 qui prévoit notamment la réinformatisation, le transfert sur informatique et la mise en ligne du catalogue des collections entrées avant 1920, quatre programmes de recherche (bibliographie alsacienne....).
le contrat quadriennal 2009-2010